Фамилия Мирудко — редкий пример, где суффикс указывает на географию точнее, чем корень. Формант -ко характерен для украинской и белорусской ономастики, особенно для запада Украины и юга Беларуси. В России такие фамилии встречаются реже, чаще в приграничных областях — Брянской, Смоленской, Курской. Сама модель образования типична: от прозвища или имени с помощью уменьшительного суффикса -к-, за которым следует патронимическое окончание -о (в украинской традиции оно часто означает «сын» или «потомок»).

Корень Мируд- неочевиден и допускает несколько прочтений. Самая прямая версия — от личного имени Мирон (в просторечии Мируда, Мирутка). В украинском языке имя Мирон давало формы Мирудь, Мируда, а Мирудко — уже «маленький Мирон» или «сын Мирона». Это типичный путь для фамилий на -ко: они часто вырастали из домашних имён, а не из прозвищ.

Вторая гипотеза — связь с диалектным словом «мируда». В некоторых говорах так называли тихого, кроткого человека, либо, наоборот, того, кто «мирится» со всеми, улаживает ссоры. Прозвище Мируда могло закрепиться за миротворцем или просто за спокойным соседом. Тогда Мирудко — «потомок Мируды».

Третья, менее вероятная версия — искажённое «Миргород» или «Миргородский». В украинской среде фамилии от названий городов нередко усекались: Миргород → Миргуд → Мирудко. Но это лишь предположение, без подтверждения в старых переписях.

Письменных свидетельств о фамилии Мирудко в документах XVII–XVIII веков почти нет, что неудивительно: она локальная и немногочисленная. Встречается в основном на Черниговщине и в Гомельской области Беларуси. Сословного барьера у неё не было — носителями могли быть и крестьяне, и казаки, и мещане. Сегодня фамилия остаётся редкой: по открытым данным, в России её носит не более нескольких сотен человек, в основном в юго-западных регионах.