Фамилия Мирзагатов образована по тюркской модели с арабско-персидским корнем. Основа — составное имя Мирзагат, которое распадается на две части: «мирза» (от персидского «мирза» — сын эмира, позже — титул знатного человека, писаря или просто господина) и «гат» (арабское «гат» — дар, подарок). Вместе имя можно перевести как «господин-дар» или «дарованный господин» — типичное для мусульманской ономастики сложение, где второй компонент подчеркивает божественный дар ребенка.

Русский суффикс -ов превратил имя Мирзагат в фамилию: Мирзагатов буквально означает «потомок Мирзагата». Такая модель характерна для фамилий, которые закрепились у татар, башкир, казахов и других тюркских народов в XIX — начале XX века, когда Российская империя вводила обязательные фамилии для инородческого населения. Чаще всего за основу брали имя отца или деда, добавляя патронимический суффикс.

Интересная деталь: в отличие от более частых фамилий на -ов (Мирзаев, Мирзанов), здесь сохранился полный вариант имени Мирзагат без усечения. Это указывает на то, что предок носителя фамилии был известен именно под двусоставным именем, а не сокращённым вариантом вроде Мирза. Встречается написание Мирзагатов и Мирзагатов — с ударением на второй или третий слог, что зависит от местного диалекта.

По сословной принадлежности предки Мирзагатовых скорее всего были крестьянами или мещанами, хотя само имя «мирза» намекает на знатное происхождение. В тюркской среде титул «мирза» не всегда означал реальную аристократию — к XIX веку он стал распространённым компонентом имени даже среди простых людей, особенно у казанских татар и башкир. Так что Мирзагатов — фамилия, которая звучит благородно, но говорит скорее о культурной традиции, чем о реальном дворянском статусе.