Фамилия Мирзаканов — одна из тех, где географический и социальный контекст важнее морфологического разбора. Её основа — тюркское (скорее всего, кумыкское или ногайское) имя Мирзакан, которое, в свою очередь, сложено из двух частей: «мирза» (от персидского «амир-заде» — княжич, потомок знатного рода) и уменьшительно-ласкательного суффикса «-кан» (в тюркских языках — «кровь», «родня», а в именах часто выступает как ласкательный компонент, вроде «родной»). Таким образом, Мирзакан буквально означает «маленький мирза», «мирзёнок» — прозвище или имя для младшего сына в уважаемой семье, где отца или деда уже величали Мирзой.

Русский суффикс «-ов» превратил личное имя в фамилию по стандартной модели: «чей?» — Мирзаканов, то есть потомок Мирзакана. Фамилия почти наверняка сформировалась в среде, где русская административная система фиксировала тюркские имена в документах — скорее всего, на Северном Кавказе (Дагестан, Чечня) или в астраханских степях, где ногайцы и кумыки традиционно носили такие имена. В официальных переписях XIX века у горских народов фамилии часто образовывались именно по отчеству от имени деда или отца, и Мирзаканов — типичный случай такой фиксации.

В отличие от многих фамилий на «-ов», образованных от русских прозвищ, здесь нет ремесленной или бытовой подоплёки. Мирзаканов — не «сын кузнеца» и не «внук рыжего». Это фамилия, прямо указывающая на родовитость предка (пусть и в уменьшительной форме). Интересно, что параллельно существует фамилия Мирзакаев (с другим суффиксом), а также Мирзаханов — с более полным именем Мирзахан. Мирзаканов стоит особняком: уменьшительный «-кан» в основе встречается реже, что делает фамилию более локальной и конкретной. Если носитель ищет свои корни, стоит смотреть в сторону кумыкских или ногайских родовых преданий — вероятно, предок был из сословия узденей (знатных, но не княжеского ранга), а прозвище «Мирзакан» закрепилось за ним как уважительное, но с оттенком младшинства.