Первая часть фамилии Мирзаханова восходит к тюркскому имени Мирза. На Востоке, в частности в Иране, данное имя, ставившееся в конце, могло употребляться в качестве титула членов царствующей династии. Первоначально «хан» обозначал вождя племени (например, у кочевников Ирана и Афганистана). Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Мирзахановых можно лишь на основании генеалогических исследований.