Фамилия Мирзаянов восходит к тюркскому имени Мирзаян (вариант имени Мирзаджан). Оно состоит из двух компонентов: Мирза (от «мурза» - «князь») и Джан (в переводе с персидского - «душа»). Имя Мирзаджан носил армянский князь Хачена XVI века, сын князя Джганше II. Его владения охватывали Верхний Хачен. Резиденция князя находилась в местечке Цар (на территории нынешнего Кельбаджарского района).