Фамилия Мирзеагаев — редкий случай, когда в основе лежит не просто имя, а составной титул с двойным корнем. Она образована по азербайджанской (тюркской) модели с русским суффиксом принадлежности -ев, который в XIX–XX веках добавили при оформлении фамилий в документах.

Первая часть — «Мирза» (от персидского «мирза»). Это слово имеет два значения: либо сокращение от «эмир-заде» (княжич, потомок правителя), либо, в более поздней и бытовой традиции, — грамотный человек, писец, чиновник. В Азербайджане, Дагестане и Закавказье «Мирзой» часто называли не только знатного, но и образованного человека, ведущего делопроизводство.

Вторая часть — «ага» (от тюркского «старший брат», «господин»). В Османской империи и у народов Кавказа ага — уважительное обращение к старшему, землевладельцу или военному командиру. Соединение «Мирза-ага» — это сложносоставное личное имя или прозвище, которое буквально означало «господин, происходящий из писцов» или «уважаемый грамотей». Встречается также вариант написания Мирза-Агаев, где дефис указывает на сращение двух слов.

Таким образом, Мирзеагаев — это патронимическая фамилия, то есть «сын Мирза-аги». Предок носителя этой фамилии, скорее всего, жил на территории современного Азербайджана или среди тюркоязычных народов Дагестана и носил двойное имя-титул Мирзаага. В русских метрических книгах и ревизских сказках XIX века такие сложные имена часто записывали слитно, а затем прибавляли стандартный русский фамильный суффикс. Фамилия почти не встречается за пределами постсоветского Закавказья, что подтверждает её узкую региональную привязку.