Основой фамилии Мисайлова послужило церковное имя Мисаил. Имя Мисаил представляет собой еврейский вариант крестильного имени Михаил. В свою очередь, имя Михаил происходит из древнееврейского языка, где имеет значение «кто – как Бог». Наиболее известным святым покровителем этого имени является Архангел Михаил, который является главой святого воинства ангелов, стоящих на страже Божьего закона. Скорее всего, основатель рода Мисайловых был человеком с высоким социальным статусом. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Мисаил, со временем получил фамилию Мисайлов.