Фамилия Мисейкис звучит для русского уха непривычно, и это не случайно: это яркий маркер литовского происхождения. Её выдает суффикс -ис, который в литовской ономастике выполняет ту же роль, что русские -ов и -ин — указывает на принадлежность или происхождение. Без этого окончания перед нами была бы основа Мисейк-, которая восходит к уменьшительной форме личного имени.

В основе фамилии лежит мужское имя Мисейка — литовский вариант уменьшительного от имени Миколас (литовский аналог Николая) или, реже, от Доминикас. В литовском языке распространены уменьшительные формы с суффиксом -ейк- (-eik-), которые затем оформлялись фамильным окончанием -ис. Таким образом, Мисейкис буквально означает «сын Мисейки» или «принадлежащий Мисейке». Схема образования та же, что у множества литовских фамилий вроде Будрейкис, Растейкис или Ясейкис.

Географически фамилия почти наверняка привязана к территории исторической Литвы или к северо-западным регионам современной Беларуси, где веками жили литовцы и где литовские фамилии нередки. В России носители Мисейкис — это, как правило, потомки литовцев, переселившихся в имперский период, либо люди, чьи предки сохранили фамилию при русификации документов в XIX веке.

Интересно, что фамилия не имеет прямого отношения к ремеслу или прозвищу — она целиком «именная», патронимическая. Это значит, что предок носителя был просто человеком, которого в своей общине знали как Мисейку, то есть «Миколку» или «Николашу» на литовский лад. Никакого тайного смысла или забытой профессии здесь нет, зато есть чёткая ниточка к литовской языковой и культурной среде.