Маловероятно, что фамилия Мишалуев связана с крестильным мужским именем Михаил, которое в переводе с древнееврейского означает «благонравный». Скорее всего, она имеет тюркское происхождение и состоит из двух татарских слов: «мичче» - «печник» и «алу» - «брать». Согласно другой версии, она восходит к киргизскому слову «мичеуле» - «пристяжной».