Фамилия Мишалуева — женская форма фамилии Мишалуев, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффиксального строения, которое выдаёт региональное происхождение. Суффикс -ев (вместо привычного -ов) указывает на то, что основа фамилии оканчивалась на мягкий согласный или шипящий. В русской ономастике это характерно для южнорусских и белорусских земель, где фамилии на -ев встречаются чаще, чем на севере и востоке.

Корень фамилии — Мишалуй. Это явно прозвище, а не каноническое имя. В нём слышится основа «миша» (народная форма имени Михаил) и глагольный элемент «луй» — от древнерусского «луть» (бить, колотить) или диалектного «лукать» (кидать, швырять). Таким образом, Мишалуй могло означать «Миша-забияка» или «Миша, который швыряется», то есть прозвище дали человеку с буйным или неуёмным нравом.

Версия, что перед нами тюркское или финно-угорское заимствование, маловероятна: звуковой облик «мишалуй» не находит убедительных параллелей в этих языках, а суффикс -ев — исконно славянский. Поэтому основная гипотеза — прозвище из русской диалектной среды, скорее всего, в южных областях (Курская, Орловская, Воронежская губернии), где фиксировались фамилии с подобной структурой.

Социальный контекст: носители фамилии Мишалуев (и Мишалуева) в XIX веке относились к крестьянскому или мещанскому сословию. Дворянских родов с такой фамилией не известно, что подтверждает её прозвищное происхождение из простонародной среды. Фамилия редкая, нечастотная даже в местах своего бытования.

Если сравнивать с однокоренными, то родственными можно считать фамилии Мишалов, Мишаев, Мишалкин — все они образованы от имени Михаил, но с разными суффиксами. Мишалуева стоит особняком из-за глагольной части, которая делает её не просто патронимической, а характеризующей.