Фамилия Миштур — редкая и неочевидная. Если смотреть на неё через призму привычных русских фамильных суффиксов, сразу бросается в глаза отсутствие типичных окончаний -ов, -ин, -ский. Перед нами «чистая» основа, что для русской фамилии нетипично. Это сразу подсказывает: корни, скорее всего, не великорусские, а польские, белорусские или украинские, где такие бессуффиксные фамилии в порядке вещей.

Самая прямая версия — топонимическая. В Польше и на западе Беларуси есть несколько населённых пунктов с названием Миштуры (Miszczury, Misztury). Фамилию мог получить человек, переехавший из такого села и названный по месту прежнего жительства: «откуда родом? — Из Миштуров». Такая модель образования фамилий (на -а/-я для обозначения выходца) широко распространена в шляхетской и крестьянской среде Речи Посполитой.

Другая, более глубокая версия — прозвищная. Основа «миштур» может восходить к диалектному польскому слову «miszcza» или «misztura» — в некоторых говорах так называли мешанину, путаницу, нечто сборное. Прозвище Миштур могли дать человеку, который занимался смешиванием чего-либо (например, красок, кормов, металлов) или же отличался неразборчивостью в делах. Впрочем, это предположение остаётся гипотетическим: словарь Б. Унбегауна не фиксирует такого прозвища в русском контексте, а польские источники по ономастике указывают на преобладание именно географического следа.

С точки зрения социальной истории, носители фамилии Миштур в XIX веке встречаются в документах Гродненской и Минской губерний — на территории бывшего Великого княжества Литовского. Среди них были и крестьяне, и мелкая шляхта. Это подтверждает версию о западном происхождении: фамилия не уходила далеко на восток и оставалась локальной.

Таким образом, с наибольшей вероятностью фамилия Миштур — это указание на родом из местечка Миштуры, а её носители — потомки жителей западнорусских или польских земель.