Фамилия Мишкур — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Чтобы понять её корни, стоит в первую очередь посмотреть на суффикс. Окончание -ур встречается в русских фамилиях нечасто, и это сразу наводит на мысль, что перед нами не стандартная модель на -ов/-ев или -ин. Чаще всего -ур — это элемент, пришедший из украинского, польского или белорусского языков, где он мог выполнять роль суффикса, указывающего на носителя признака или профессии. Сравните: Мишкур, Шкур, Костур.

Основа фамилии — «Мишк-». Самое простое объяснение: это производное от имени Михаил (Миша, Мишка). В таком случае Мишкур — это, скорее всего, прозвище: «тот, кто похож на Мишку» или «маленький Миша». Но есть и другая, более интересная версия. В южнорусских и украинских говорах слово «мишку́р» или «мишкура́» могло означать нечто мелкое, суетливое, или же относиться к ремеслу — например, к человеку, который что-то мельчил, крошил (от «мишкать» — медлить, возиться). Похожий след оставила и польская лексика: «miszkur» — это «мешок», что могло стать прозвищем торговца или носильщика.

Географически фамилия Мишкур тяготеет к западу и югу России, а также к Украине и Беларуси. Встречается она в основном в чернозёмной полосе и на Кубани, что косвенно подтверждает версию о западнославянском или украинском корне. Сословно носители фамилии чаще всего были крестьянами или мещанами, но без архивных данных утверждать что-то конкретное сложно.

Таким образом, Мишкур — это фамилия-загадка с несколькими равноправными версиями. Самая правдоподобная: она образована от имени Миша с редким суффиксом -ур, указывающим на принадлежность или характерный признак. Альтернатива — прозвище по роду занятий или поведению, связанное с диалектным словом. Однозначного ответа нет, но обе гипотезы укладываются в общую картину русской ономастики.