Фамилия Мишков напрямую отвечает на вопрос «чей ты будешь?» — она означает «сын Мишка». В основе лежит не полное имя, а его уменьшительная форма Мишко, которая в старину была распространена в украинских и южнорусских говорах. Если полное имя Михаил переводится с древнееврейского как «благонравный» или «тот, кто подобен Богу», то ласковое Мишко звучало проще и по-домашнему — так звали мальчишек и парней в семье, а потом это прозвище закрепилось за их потомками.

Словообразовательная модель здесь классическая: суффикс -ов присоединялся к основе, чтобы указать на принадлежность. Мишко → Мишков — это буквально «Мишков сын». Подобным образом строились тысячи русских фамилий, но именно форма Мишко, а не привычный Миша, выдает южное или западнорусское происхождение рода. На севере и в центральной России чаще сказали бы «Мишин», а вот «Мишков» — это след той диалектной среды, где имя произносили через окончание -о.

Интересно, что фамилия сохранила эту уменьшительную форму в первозданном виде, не переделав ее в более «литературную» Мишин. Это редкий случай, когда уличное прозвище отца или деда стало официальным родовым именем без изменений. В переписях и ревизских сказках такие фамилии часто записывали по живому произношению, поэтому Мишковы могли встречаться и в казачьих станицах, и среди крестьян Черниговщины, и в переселенческих деревнях за Уралом.

Есть и другая, менее вероятная версия: в некоторых говорах Мишком могли прозвать и медведя, но она слабая — для медведя в народе использовали другие имена (Топтыгин, Потапыч), а человеческое имя Михаил в уменьшительной форме встречалось повсеместно. Так что основная линия происхождения фамилии — от личного имени, и именно ее стоит считать верной. Носители фамилии Мишков сегодня могут не знать своих предков по именам, но сама фамилия хранит память о том, что в роду был человек, которого домашние звали Мишком.