Фамилия Мисирпашаев — редкий случай в русском ономастиконе, где восточная составная основа соединилась с русским патронимическим суффиксом -ев. Она образована от личного имени или прозвища Мисирпаша, которое, в свою очередь, состоит из двух тюркских компонентов: «Мисир» (арабское «Миср» — Египет) и «паша» (высокий османский титул, примерно соответствующий князю или генералу). Буквально это можно перевести как «египетский паша» или «паша из Египта». Такое имя-титул давали не по должности, а как почётное прозвище — либо человеку, побывавшему в Египте, либо тому, кто в глазах окружающих ассоциировался с чем-то египетским (торговал египетскими товарами, носил одежду в восточном стиле или имел смуглую внешность).

Суффикс -ев указывает на принадлежность: Мисирпашаев буквально означает «сын Мисирпаши». Фамилия явно сформировалась на территории, где русская административная система фиксации фамилий столкнулась с тюркской антропонимией — скорее всего, в Закавказье или на Северном Кавказе, в среде азербайджанцев, кумыков или народов Дагестана. В этих краях титул «паша» и топоним «Мисир» были в ходу, а русская фамильная модель прижилась после вхождения региона в состав империи.

В отличие от фамилий с чисто русскими корнями, Мисирпашаев не имеет отношения к крестьянским прозвищам от профессий или черт характера. Это скорее элитарное имя, указывающее на уважаемого человека, возможно, военного или торговца. Аналогичные составные фамилии — Алипашаев, Османпашаев — встречаются в тех же регионах, но Мисирпашаев выделяется географической привязкой: «Мисир» здесь не просто имя, а указание на дальнюю страну, что делает фамилию особенно запоминающейся.

Написание фамилии устойчиво, вариантов вроде Мисирпашаев или Мисир-Пашаев практически не встречается — русская орфография сплавила две основы в одно слово. Носители фамилии сегодня живут в основном в Дагестане и Азербайджане, реже — в Турции, куда она могла попасть с мухаджирами (переселенцами с Кавказа). Из-за редкости фамилии её носители, скорее всего, связаны единым родом, восходящим к одному предку — тому самому «египетскому паше», чьё прозвище закрепилось в документах XIX века.