Фамилия Мисиянцев, предположительно, образована от прозвища Мисиянец, восходящего к топониму Мисянцы. Так называется местечко, расположенное в Браславском районе Витебской области Белоруссии. Вероятно, именование Мисиянец указывает на место, родом из которого был человек. Так могли назвать выходца из местечка Мисянцы. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Мисиянец, со временем получил фамилию Мисиянцев.