Фамилия Мисиян — редкая и неоднозначная, её происхождение упирается в два основных корня: географический и личный. Проще всего объяснить её как вариант фамилии Мисиян, образованной от названия реки Миси (приток Кубани) или от этнонима «мисы» — древнего племени, жившего в Западной Грузии. В таком случае суффикс -ян указывает на армянскую модель образования фамилий, характерную для юга России и Закавказья: «Мисиян» буквально означает «из рода Миса» или «выходец с Миси». Однако есть и вторая версия, более прозрачная для славянского уха: основа «мис» могла быть прозвищем человека, который постоянно «мисил» — мял, месил что-то (глину, тесто). В русских говорах слово «мисить» означало «месить», «мять», и такое прозвище легко давали пекарю, гончару или строителю, работавшему с глиной.

С точки зрения словообразования фамилия выбивается из типично русской модели. Суффикс -ян не характерен для восточнославянских фамилий — он пришёл из армянского языка, где выполняет ту же роль, что русские -ов/-ев или -ин. Поэтому большинство носителей фамилии Мисиян в России и на Украине — это потомки армян, переселившихся в Причерноморье или на Кубань в XIX–XX веках. Если же фамилия встречается у русских, это, скорее всего, результат русификации армянской фамилии или, реже, её независимого возникновения от прозвища «Миса» (уменьшительное от Михаил, Дмитрий и т.п.) с последующим добавлением -ян под влиянием местных говоров.

География фамилии узкая. Основные очаги — Краснодарский край, Ростовская область, Ставрополье, а также Армения. В центральной России она почти не встречается. Социальный состав предков, вероятно, был смешанным: среди носителей фамилии могли быть и крестьяне-переселенцы, и ремесленники, и торговцы. Дворянских родов с такой фамилией исторические источники не фиксируют.

Спорный момент — возможная связь с тюркским словом «мис» (медь). Если фамилия восходит к прозвищу Мис (медник, торговец медью), то суффикс -ян снова указывает на армянскую среду, где такие прозвища были распространены. Но эта версия слабее: в тюркских языках «мис» — заимствование из персидского, и в русских говорах это слово не прижилось как прозвище. Более правдоподобно именно «месильное» или топонимическое происхождение.

В итоге: фамилия Мисиян — почти всегда маркер армянских корней, но с возможным славянским прозвищным подтекстом. Если ваш предок носил её на Кубани, скорее всего, он был либо выходцем из армянской общины, либо человеком, чьё занятие было связано с мешением глины или теста.