Фамилия Миссарова — женская форма фамилии Миссаров, и её происхождение почти наверняка связано с тюркским миром. Основа «миссар» восходит к арабскому слову «миср» (страна, город, область), которое в тюркских языках приобрело значение «египтянин» или, шире, «житель Египта». В Поволжье, особенно у татар и башкир, прозвище Миссар (или Мисар) могли дать человеку, который торговал с Египтом, побывал там или просто имел смуглую внешность, напоминавшую южанина. Встречается и вариант Миссаров — с русским патронимическим суффиксом -ов, указывающим на принадлежность: «сын Миссара».

Фамилия редкая и географически привязана к регионам, где исторически жили татары или башкиры: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская область. Встречается она и у русских, но в таких случаях, скорее всего, это результат обрусевания тюркской фамилии в XIX–XX веках. Интересно, что в некоторых говорах «миссар» могло быть искажением слова «миссионер» — так в народе могли прозвать странствующего проповедника или монаха, но эта версия менее вероятна из-за отсутствия широкого распространения такого прозвища.

Словообразовательная модель проста: корень «миссар» плюс суффикс -ов, типичный для русских фамилий, образованных от прозвищ. Суффикс -а в женской форме — стандартное окончание для указания на женщину из рода Миссаровых. Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Миссаров, Мисаров, Мисаркин, — все они тяготеют к восточному корню и не имеют славянских параллелей.

Сословно носители фамилии, судя по архивным данным, в основном были крестьянами и мещанами, реже — купцами (встречаются в списках казанских и оренбургских купцов XIX века). Известных исторических личностей с этой фамилией нет, что делает её типичной для «народной» ономастики, где фамилия отражает прозвище, а не титул или профессию.