Фамилия Митрушина образована от обиходной формы мужского имени, а не от полного канонического имени. В её основе лежит имя Митруша — так в быту могли звать человека, носившего одно из двух крестильных имён: Митрофан или Дмитрий. Словообразовательная модель проста: к основе Митруш- добавлен притяжательный суффикс -ин, который указывает на принадлежность потомку человека с этим именем. Форма с суффиксом -ин, а не -ов, типична для имён, оканчивающихся на -а, поэтому ответ на вопрос «чей ты?» звучал как «Митрушин сын», «Митрушина дочь».

Имя Митрофан пришло из греческого языка и переводится как «слава матери» или «найденный матерью». Другая версия связывает Митрушу с именем Дмитрий, что в переводе означает «принадлежащий Деметре» — древнегреческой богине плодородия. Обе гипотезы имеют право на существование, но первая выглядит предпочтительнее: сокращение Митрофан до Митруша фонетически естественнее, чем образование той же формы от Дмитрий, которое обычно даёт варианты Митя, Митька, Митюша.

Сама форма имени многое говорит о социальном положении предков. В XV–XVI веках, когда фамилии начинали закрепляться в среде богатых и знатных людей, полным именем называли уважаемых представителей верхушки. Простые же люди — крестьяне, ремесленники, рабочие — чаще использовали уменьшительные и обиходные формы. Имя Митруша относится именно к таким, поэтому основатель рода Митрушиных, скорее всего, был выходцем из рабочей или крестьянской среды. Его соседи звали его коротко и по-свойски, и это прозвище закрепилось за его детьми и внуками как фамилия.

Интересно, что фамилия сохранила архаичную форму женского рода. В русской традиции притяжательные фамилии на -ин могли использоваться для обозначения всей семьи, и форма Митрушина в некоторых говорах закреплялась за родом в целом. Сегодня она воспринимается как женский вариант фамилии Митрушин, но в исторической перспективе это вполне самостоятельное образование.