Фамилия Митрушкин образована от имени Митрушка, которое, по одной из гипотез, образовано от крестильного имени Митрофан. Это имя в переводе с греческого языка означает «слава матери», «найденный матерью». Согласно другой версии, это имя является производной формой от канонического мужского имени Дмитрий, которое имеет греческое происхождение и переводится на русский язык как «принадлежащий Деметре». Таким образом, потомок человека, которого звали Митрушка, со временем получил фамилию Митрушкин.