Фамилия Митрушкова — женская форма от Митрушков, а в её основе лежит редкая словообразовательная модель. В отличие от массовых фамилий на -ов/-ев или -ин, здесь мы видим суффикс -к-, который в русских фамилиях обычно указывает на прозвище или уменьшительную форму имени. Корень фамилии — Митруш-, что является просторечной, народной формой от канонического имени Дмитрий. В русской традиции имя Дмитрий давало множество производных: Митя, Митюха, Митяй, Митроха, Митрош, Митруш. Форма Митруш — это не столько ласкательное, сколько обиходное, «деревенское» сокращение, характерное для северных и центральных губерний России, где звук «ф» в заимствованных именах часто заменялся на «х» или «ш» (ср. Евдоким — Овдоким, Фёдор — Хведор). Таким образом, Митруш — это Дмитрий в простонародном произношении.

Суффикс -к- в фамилии Митрушков мог появиться двумя путями. Первый: отчество от прозвища Митрушко (с суффиксом -к- как в именах Ивашко, Петрушко), которое затем перешло в фамилию по схеме «чей? — Митрушков». Второй: фамилия могла образоваться непосредственно от имени Митруш с помощью уменьшительного суффикса -к- (Митрушок, Митрушка), который в родительном падеже дал форму Митрушкова. В любом случае, фамилия указывает на то, что предок носителя был человеком незнатного происхождения — крестьянином или посадским, у которого в быту не использовали полное церковное имя, а звали по-простому, по-домашнему.

Географически фамилия Митрушков (и её женская форма) встречается редко, с очагами в Вологодской, Костромской и Кировской областях — в тех регионах, где были сильны старообрядческие традиции и где сохранялись архаичные формы имён. В отличие от фамилии Митрофанов (от полного имени Митрофан), Митрушков однозначно восходит к Дмитрию, что подтверждается и народными говорами: в вологодских диалектах «Митруха» и «Митруш» — обычные варианты обращения к Дмитрию. Споров среди ономастов здесь нет: все сходятся на том, что Митруш — это производное от Дмитрий через цепочку Митя > Митруха > Митруш.

Особенность этой фамилии — её «непарадность». В XIX веке, при переписях, крестьянам часто записывали фамилии по отцу или деду, используя ту форму имени, которая была в ходу в семье. Если деда звали Митруш, то внуки становились Митрушковыми. Это не искусственная канцелярская фамилия, а живая, народная, закрепившая то, как человека называли в повседневной жизни. Поэтому Митрушкова — это фамилия-воспоминание о конкретном человеке Дмитрии, которого в родной деревне звали коротко и по-свойски.