Фамилия Мизерина — редкий пример, когда основа читается почти буквально, но значение оказывается неожиданным. На слух она напоминает что-то связанное с «мизером» — малым, ничтожным количеством. Однако в русских говорах слово «мизер» имело и другое, вполне конкретное значение: так называли мелкий, скудный урожай или плохую, тощую землю. Прозвище Мизера могли дать крестьянину, который обрабатывал неплодородный участок, или человеку невысокого роста, щуплому — в переносном смысле «мизерный» означало «худой, тщедушный».

Модель образования проста: суффикс -ин указывает на принадлежность. Мизерин — буквально «сын Мизеры» или «человек из семьи Мизеры». Форма на -ин типична для северных и центральных областей России, где фамилии часто образовывали от прозвищ без дополнительных суффиксов. В южных и западных регионах тот же корень мог дать фамилию Мизерный или Мизеренко.

Есть и другая, менее вероятная, версия: от диалектного «мизюра» — так в некоторых местах называли плаксу или нытика. Тогда прозвище носило бы характер укоризны. Но первая гипотеза выглядит убедительнее благодаря прямой связи с хозяйственным укладом: земля и урожай были главными заботами крестьянина, и прозвище по качеству надела — обычная практика.

Фамилия редкая, в списках частотных не встречается. Её носители, скорее всего, происходят из одного или нескольких смежных регионов — возможно, из Поволжья или северо-западных областей, где слово «мизер» в значении «неурожай» фиксируется диалектологами. В дворянских родословных книгах Мизерины не значатся: это однозначно крестьянская или мещанская фамилия, возникшая в среде, где прозвище закреплялось за целым родом.