Фамилия Могилёвкина отвечает на вопрос «чей?» и образована от мужского прозвища Могилёвка через притяжательный суффикс -ин. Форма женского рода указывает, что первоначально так называли дочь, жену или вдову человека с этим прозвищем. В мужском варианте фамилия звучит как Могилёвкин.

Главная версия происхождения — топонимическая. Прозвище Могилёвка могли дать человеку, который приехал из города Могилёва (ныне областной центр в Белоруссии) или из одной из многочисленных деревень с таким названием, разбросанных по России и Украине. В старину выходцев из конкретного города часто именовали по месту прежнего жительства, и такие прозвища легко закреплялись за переселенцами. Связь с топонимом — самая правдоподобная, потому что она объясняет и географическую распространённость фамилии, и её звучание.

Есть и вторая гипотеза, которая отталкивается от нарицательного «могила». В этом случае Могилёвка — прозвище, данное человеку по месту жительства у кладбища, по характеру (мрачный, нелюдимый, «тёмный как могила») или по роду занятий. Последний вариант любопытен: в некоторых говорах могильщика называли именно могилёвкой, так что прозвище могло быть профессиональным указанием на деятельность предка — рытьё могил. Однако эта версия менее убедительна: прозвища от названий профессий обычно строились по другим моделям (Могильник, Могильщик), а форма Могилёвка чаще указывает на географическое происхождение.

Сам суффикс -к- в основе прозвища добавляет оттенок уменьшительности или, что вероятнее, указывает на принадлежность к местности: Могилёвка — это «житель Могилёва». Подобная модель широко представлена в русских фамилиях: Казанцев, Тверитинов, Ростовцев. Фамилия Могилёвкина стоит в одном ряду с ними, и её носители, скорее всего, вели свой род от человека, который когда-то покинул Могилёвскую землю и осел в другом краю. Точных сведений о сословной принадлежности первых носителей нет, но массовое распространение таких фамилий приходится на XVII–XIX века, когда крестьяне и посадские люди активно переселялись в центральные и восточные губернии России.