Фамилия Молдовская — классический пример фамилии, образованной по топонимической модели с суффиксом -ск-. Этот суффикс в русской ономастике чаще всего указывает на связь с географическим объектом: селом, городом или местностью. В данном случае основа — «Молдов(а)», то есть территория, исторически связанная с Молдавским княжеством или Бессарабией. В отличие от фамилий на -ов/-ин, которые обычно возникали из прозвищ или отчеств, фамилии на -ский в среде дворянства и духовенства часто давались по названию родового поместья или места службы. У крестьян и мещан такие фамилии могли закрепиться, если человек переселился из Молдавии или жил в местности, которую в быту называли «Молдова» — например, так именовали некоторые слободы и хутора на юге Украины и в Новороссии.

В русском языке фамилия Молдовская — женская форма, мужской вариант будет Молдовский. Оба варианта фиксируются в документах с XIX века. Интересная особенность: в отличие от фамилии Молдаванов (от этнонима «молдаванин»), Молдовская не указывает напрямую на национальность. Она говорит о происхождении с определённой территории или о принадлежности к населённому пункту с таким названием. В метрических книгах и ревизских сказках по Бессарабской губернии и Херсонской губернии встречаются и Молдовские, и Молдавские — написание колебалось, так как в XIX веке не было строгой орфографической нормы для фамилий.

С точки зрения социальной истории, носители фамилии Молдовская могли принадлежать к разным сословиям. В дворянских родословных книгах южных губерний попадаются Молдовские — выходцы из польской шляхты, осевшие на землях бывшего Молдавского княжества. Но чаще фамилия встречается среди крестьян и мещан, особенно в Одессе, Кишинёве и сёлах вдоль Днестра. Иногда фамилию давали воспитанникам духовных семинарий — так называемые «семинарские» фамилии нередко образовывали от названий епархий или монастырей, но Молдовская в этом списке редка.

Спорных версий происхождения у этой фамилии немного. Самая маловероятная — от слова «молодой» через диалектное «молдой»; эта гипотеза не выдерживает критики, так как суффикс -овск- чётко привязан к топониму, а не к прилагательному. Более правдоподобно, что в основе лежит река Молдова (приток Сирета в Румынии), давшая название исторической области. Так что предки носителя фамилии Молдовская, скорее всего, либо жили на землях, которые входили в состав Молдавского княжества, либо переселились оттуда в Российскую империю в XVIII–XIX веках — во время массовых миграций молдаван и украинцев на свободные земли.