Скорее всего, фамилия Моллот восходит к французскому слову mollot – «тихо, потихоньку; осторожно». Согласно другой, менее правдоподобной версии, в основе этой фамилии лежит искаженное нецерковное имя Молот: такие имена, образованные от названий инструментов были распространены в старину на Руси.