Фамилия Молочко чаще всего — след мирского имени или прозвища, которое в старину давали в дополнение к крестильному. В основе лежит слово «молоко», и здесь есть несколько версий, и они не исключают друг друга.

Самая простая и распространённая: Молочком ласково называли ребёнка, которого долго вскармливали материнским молоком. Такое имя-оберег могло подчёркивать связь с матерью, здоровье и младенческий возраст. В крестьянской среде мирские имена типа Молоко, Молочко встречались нередко — они звучали тепло и по-домашнему.

Но у фамилии есть и вторая сторона. В основе могло лежать не только мирское имя, но и прозвище Молочко, которое давали взрослому человеку. Прозвище это закреплялось за тем, кто торговал молоком, держал молочную лавку или просто имел отношение к молочному делу — пастух, скотник, сыровар. В этом случае фамилия указывает на ремесло, а не на внешность или характер.

Форма фамилии — без суффикса, чистая основа. Это типично для украинской и южнорусской традиции, где фамилии на -ко (Молочко, Бойко, Шевченко) образовывались напрямую от прозвищ и имён. В северных и центральных русских землях чаще появилось бы Молочков или Молочников, а вот Молочко — маркер юго-западного ареала: Украина, Белоруссия, юг России.

Спорная версия — связь с молочными продуктами как символом достатка. Вряд ли фамилию давали за любовь к молоку; скорее, за дело или за ласковое обращение в семье. Самая правдоподобная линия: сначала ласковое домашнее имя ребёнка, потом — фамилия без изменений, как это часто бывало в западнорусских землях.

Отдельно стоит сказать о созвучных фамилиях. Молочников — это однозначно профессиональная фамилия, от «молочник», торговец молоком. Молочко же стоит ближе к личному имени, хотя и не исключает ремесла. Разница тонкая, но она определяет, кем был предок: прозвище по занятию или домашнее имя, данное с любовью.