Фамилия Молоткова с большой долей вероятности восходит к прозвищу или нецерковному имени Молоток. В старину на Руси были широко распространены имена, образованные от названий предметов обихода и инструментов: Топор, Лопата, Ковш. Молоток из этого ряда, и он мог стать личным именем, которое давали ребенку как оберег или по случайному признаку. Однако более правдоподобной выглядит версия, связывающая фамилию с прозвищем Молоток, которое закрепилось за мастеровым человеком — плотником. Молоток здесь понимается в прямом значении: металлический или деревянный брусок на рукоятке, служащий для забивания гвоздей и ударов по долоту или стамеске. Так что предок носительницы фамилии, скорее всего, был плотником — человеком, чья работа напрямую связана с этим инструментом.

В основе фамилии лежит не церковное, а мирское имя или прозвище, что типично для русских фамилий, сложившихся в крестьянской и ремесленной среде. Суффикс -ов- в окончании женской формы Молоткова указывает на притяжательное значение: «дочь или жена Молотка». Мужской вариант — Молотков. Такая модель образования фамилий была самой распространенной на Руси в XV–XVII веках, когда прозвище отца переходило к детям и закреплялось за родом.

Интересно, что фамилия не указывает на конкретный регион: прозвище Молоток могло возникнуть в любой местности, где занимались строительством и деревообработкой. Однокоренные фамилии — Молотков, Молотковский, Молоткин — родственны ей и тоже восходят к этому инструменту или прозвищу. В отличие от фамилий, образованных от канонических имен, Молоткова сразу говорит о роде занятий предка, а не о его происхождении или сословии. Это фамилия-профессия, каких немало в русском ономастиконе: Кузнецов, Плотников, Столяров.