Фамилия Моргонцов — один из тех случаев, когда исходное прозвище почти не оставило следов в литературном языке, но крепко закрепилось в народной речи. В её основе лежит глагол «моргать», но не в современном значении «мигать веками», а в более старом и грубом — «мигать, подмигивать, подавать знак глазами». От него образовалось прозвище Моргун или Моргон — так в старину называли человека, который часто моргал, щурился или имел привычку хитро подмигивать. Форма Моргонец — это уже уменьшительно-пренебрежительный вариант, а суффикс -ов добавил фамилии стандартное окончание, превратив прозвище в родовое имя.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: основа Моргон- (от Моргон) плюс типичный русский суффикс принадлежности -ов. Такие фамилии обычно возникали у крестьян и посадских людей в XVI–XVII веках, когда прозвище отца переходило к детям без изменений, а потом закреплялось документально. В отличие от фамилий на -ский или -ин, Моргонцов — чисто «прозвищная» фамилия, без географической или сословной привязки. Её носители могли быть кем угодно: от смоленского крестьянина до московского ремесленника.

Интересная деталь: в русских говорах слово «моргон» имело и более конкретное значение — так иногда называли человека с бельмом на глазу или с косоглазием. В словаре Владимира Даля «моргун» — это ещё и «тот, кто беспрестанно моргает», а «моргон» могло быть вариантом того же корня. Поэтому вторая версия происхождения фамилии — от физического недостатка или особенности зрения. Обе гипотезы не противоречат друг другу: в любом случае прозвище было дано по внешней примете или поведению.

Фамилия редкая, не входит в число распространённых. Её можно встретить в центральных областях России, особенно в бывших Смоленской и Тверской губерниях, где сохранились диалектные формы глагола. Встречаются варианты написания — Морганцов (через «а»), что может указывать на акающее произношение, или Моргонцев, где суффикс -ев появился из-за смягчения конечного согласного. Но основная форма — Моргонцов — наиболее логична: она прямо выводится из прозвища Моргон, без лишних фонетических сдвигов.

Однокоренных фамилий немного: Моргунов, Моргалёв, Моргачёв. Все они образованы от того же корня, но с разными суффиксами, что говорит о самостоятельном бытовании прозвищ в разных регионах. Моргонцов стоит в этом ряду особняком — из-за редкой основы на -он, которая встречается реже, чем более типичные -ун или -ач.