Фамилия Моркусон с большой долей вероятности — фонетический вариант более распространённой фамилии Маркусон. Обе они образованы по одной модели, но разошлись в написании из-за особенностей произношения: безударная «а» в начале слова звучит как «о», и это звучание со временем закрепилось на письме у части носителей. Так что Моркусон — это не самостоятельная фамилия, а ответвление, которое живёт своей жизнью.

Основа фамилии — личное имя Маркус, латинское по происхождению. Его переводят двояко: чаще как «молот», реже как «сухой, увядающий». Первая трактовка выглядит убедительнее: она связана с римским богом войны Марсом, а имя Марк, от которого Маркус — уменьшительная форма, носили многие древние римляне. Со временем имя распространилось по Европе вместе с христианством, а в еврейской среде ашкеназов стало использоваться как светское, бытовое имя наряду с религиозным.

Ключ к происхождению фамилии — формант -сон, который в буквальном переводе с идиша и немецкого означает «сын». Такая модель отчества, когда к имени отца прибавляли указание на родство, типична для ашкеназских фамилий, которые массово закреплялись в XVIII–XIX веках на территориях Российской империи и Австро-Венгрии. Маркусон, а затем и Моркусон, означало «сын Маркуса» — то есть предок носителя фамилии был человеком по имени Маркус, и его дети получили прозвание по отцу.

Интересно, что фамилия сохранила архаичную форму с -сон, тогда как многие аналогичные ашкеназские фамилии позже русифицировались, превращаясь в Маркусов или Маркушин. Моркусон же остался ближе к исходному варианту, что делает его ценным маркером для генеалогического поиска: он указывает на регионы, где идиш был основным разговорным языком, — черта оседлости, Польша, Литва, Беларусь.

Встречаются и единичные случаи, когда Моркусон мог возникнуть независимо от еврейской традиции, например, как искажённая запись фамилии Моркунов или Маркусов при переписи, но это скорее исключение. Основная версия — ашкеназское происхождение — подтверждается и тем, что фамилия практически не встречается в русских крестьянских или дворянских родословных, а сосредоточена в документах еврейских общин.