Фамилия Морохин образована от личного имени или прозвища Мороха. Это мирское имя, то есть данное не при крещении, а в быту, по народной традиции. Чаще всего в его основе видят нарицательное «мороха» — так в северных и сибирских говорах называли мелкий затяжной дождь, морось. По этой версии, Морохой могли назвать ребёнка, родившегося в сырую непогоду, — имя давали по обстоятельствам появления на свет, и в этом нет ничего обидного.

Существует и вторая версия, связанная не с погодой, а с внешним видом или занятием. Она возводит прозвище Морох к слову «морх» — в некоторых говорах так называли висячие пучки нитей, бахрому, а также нечто всклокоченное, торчащее. Отсюда два возможных портрета предка: либо он был портным, имевшим дело с нитями и бахромой, либо человеком с непричёсанными, торчащими волосами, которого дразнили Морохом за неряшливый вид. Обе трактовки правдоподобны, но первая, с «моросью», выглядит более естественной для имени, которое дают ребёнку, — вторая скорее описывает взрослого человека.

Сам суффикс -ин указывает на принадлежность: Морохин буквально значит «сын Морохи». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от имён и прозвищ, оканчивающихся на -а или -я. Фамилия не дворянская и не книжная, она вышла из крестьянской или посадской среды, где мирские имена держались веками параллельно с церковными. Географически фамилия встречается в Поволжье и на Русском Севере — как раз там, где слово «мороха» в значении «мелкий дождь» было в ходу.

Стоит отличать Морохиных от однокоренных Морозовых и Морхиных. Морозов — от имени Мороз, тоже мирского, но с другим корнем. Морхин — от той же основы «морх», но с другим суффиксом, что указывает на иную ветвь прозвища. Морохин же сохранил именно форму с «а» в корне, что и позволяет связывать его с дождём. В написании фамилия устойчива: ударение обычно падает на второй слог, Моро́хин, хотя в некоторых говорах можно услышать и Мо́рохин.

Известных исторических личностей с этой фамилией в старых документах не зафиксировано, насколько можно судить по доступным источникам. Это не делает фамилию редкой в смысле ценности — она просто принадлежала людям, не попавшим на страницы хроник, что для большинства русских фамилий обычное дело. Потомок Морохи, будь то ребёнок, рождённый в дождь, или портной, работавший с бахромой, оставил по себе память в самом имени рода.