Фамилия Мошихин образована по одной из самых распространённых в русской ономастике моделей: суффикс -ин указывает на принадлежность к предку по мужской линии. В основе лежит имя или прозвище Мошиха. Скорее всего, это народная, обиходная форма личного имени — либо Моисей, либо Мокий.

Имя Моисей (древнееврейское «вынутый из воды») в русской деревне часто сокращали до Мося, Мосей, а от них с помощью суффикса -их- образовывали фамильные прозвища — Моших, Мошиха. «Мошиха» в таком случае — это жена или вдова Мося, Моисея. В северных и центральных русских говорах прозвища с суффиксом -иха были типичны для женщин, а затем закреплялись за их детьми и домочадцами как фамилия. Вторая версия — от имени Мокий (греческое «насмешник»). В народе его тоже нередко переделывали в Мокей или Мокша, а оттуда до Мошихи — один шаг.

Менее вероятная, но допустимая версия — прозвище от диалектного слова «моших» или «мошиха». В некоторых говорах так могли называть человека с мохнатой, лохматой головой (от «мох»), но это предположение не подкреплено надёжными словарными источниками. Более убедительно выглядит связь с каноническими именами, так как подавляющее большинство русских фамилий на -ин возникло именно из крестильных имён.

Географически фамилия Мошихин тяготеет к северу и северо-востоку европейской части России: встречается в Вологодской, Архангельской, Кировской областях, а также в Пермском крае. Эта зона как раз совпадает с ареалом бытования «женских» прозвищ на -иха, которые позже становились фамилиями. В переписных книгах XVII–XVIII веков такие формы — обычное дело для крестьянского сословия. Предки современных Мошихиных, скорее всего, были свободными или дворцовыми крестьянами, а не дворянами — фамилии на -их/-ых редко встречаются среди знати.

Таким образом, Мошихин — это «чей?» — сын или потомок Мошихи, то есть женщины, связанной с человеком по имени Мося (Моисей) или Мокей. Фамилия несёт в себе отпечаток деревенского быта и живой народной речи, где имя перекраивалось по законам удобства и привычки.