Фамилия Московкин ведет начало от прозвища Московка. За этим прозвищем стоят две основные версии, и первая из них связана с деньгами, а не с географией, как можно было бы предположить.

Согласно первой гипотезе, прозвище Московка происходит от названия серебряной монеты — московки. Ее чеканили в Москве, и в XV — начале XVI века она приравнивалась к половине «новгородки» (новгородской монеты). После реформы 1534 года московка составила уже половину копейки. На монете изображали всадника с саблей, из-за чего в народе ее называли «деньга сабельная» или «сабельница». Эта деталь дает основание отнести прозвище Московка к «профессиональным» именованиям, указывающим на род занятий. Вполне возможно, что основатель рода Московкиных был чеканщиком монет, специализировавшимся именно на выпуске «сабельницы», либо часто имел дело с этими деньгами — например, менял их или собирал подати.

Вторая гипотеза опирается на омоним «московка» — так называют самую маленькую птичку семейства синицевых, весом около девяти граммов. В народной речи это слово могло стать прозвищем для маленького, подвижного и ловкого человека. Такое прозвище легко закреплялось за юрким, шустрым человеком, которого сравнивали с этой крошечной птицей.

Обе версии правдоподобны, но монетная выглядит убедительнее: она объясняет появление прозвища в среде, где деньги были повседневным явлением, и согласуется с тем, что подобные «денежные» прозвища встречались в русских фамилиях нередко. Птичья версия тоже имеет право на существование, но она скорее отражает внешнюю характеристику человека, а не его социальную роль.

Сама фамилия образована по типичной русской модели: к прозвищу Московка добавили притяжательный суффикс -ин, который указывает на принадлежность потомку человека с этим прозвищем. Таким образом, Московкин буквально означает «сын Московки». Со временем прозвище закрепилось за родом и превратилось в наследственную фамилию.