Фамилия Мотохина — женская форма от Мотохин, и её корень уводит нас в мир старых русских прозвищ, где звук и смысл часто расходились с привычным нам сегодня. Основа «Мотох» или «Мотоха» — это не что иное, как диалектный вариант слова «мотыга» или глагола «мотать». В говорах северных и центральных губерний «мотохой» называли человека суетливого, непоседливого, того, кто постоянно «мотается» без дела или, наоборот, излишне хлопочет. Реже прозвище привязывалось к орудию труда — мотыге, и тогда его давали земледельцу или огороднику, работавшему с этим инструментом.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность, то есть Мотохин — это «сын Мотохи» или «человек из рода Мотохи». Интересно, что форма «Мотоха» могла быть и уменьшительно-пренебрежительной от имени Матфей или Матвей, где «Мот» — усечённый вариант, а «оха» — ласкательный суффикс. Однако эта версия менее вероятна, так как для имени Матвей более характерны фамилии Матвеев, Матюхин, Матюшин. Прозвищный корень здесь выглядит убедительнее.

Географически фамилия Мотохин не относится к массовым, но встречается в основном в северных областях России — в Архангельской, Вологодской, Кировской. Это подтверждает связь с диалектной лексикой: именно в этих краях слово «мотоха» в значении «непоседа» было в ходу. Встречается она и в Поволжье, куда носители могли переселиться в ходе колонизации земель в XVII–XVIII веках.

С точки зрения социального контекста, Мотохины, скорее всего, происходили из крестьянской или посадской среды. Прозвища, образованные от бытовых слов, редко давали знати или духовенству — они рождались в повседневной жизни, часто с доброй или ироничной усмешкой. Непоседливый «мотоха» мог быть и бойким торговцем, и непослушным работником, но в любом случае — заметным человеком в своей общине.

Написание фамилии устойчивое, без вариантов вроде Матохин, что говорит о том, что корень не перепутали с тюркским «мат» (знание, мудрость) — это редкий случай, когда диалектная русская основа не была искажена под влиянием других языков.