Фамилия Мотыгин образована от прозвища Мотыга. Оно ведет свое начало от аналогичного нарицательного со значением «ручное орудие для рыхления земли». Вероятно, прозвище Мотыга относится к числу «профессиональных» именований, содержащих указание на род деятельности основателя фамилии: он мог быть крестьянином-земледельцем. Так и прозвище Мотыга закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Мотыгин. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Мотыга, со временем получил фамилию Мотыгин.