Фамилия Мозжеков — один из тех редких случаев, где написание не совпадает с произношением. В живой речи её часто «упрощают» до Мозжаков, Мозжогов или даже Мозджаков, но исходная форма цепко держится за букву «е». Это не случайность, а ключ к происхождению.

В основе фамилии лежит прозвище Мозжек. Суффикс -ек в русских прозвищах XVI–XVII веков часто имел уменьшительно-ласкательное или ироническое значение: Мозжек — это «маленький мозг» или «мозг понарошку». Вряд ли речь шла об анатомии. Скорее всего, так дразнили человека с нестандартной головой: либо очень умного (народная ирония — «ну ты и мозг»), либо наоборот — простоватого, тугодума, которого прозвали Мозжеком в насмешку. Второй вариант встречается в ономастике чаще: прозвища от слова «мозг» обычно давали не за интеллект, а за внешность (большая лысая голова) или характер (медлительность).

Модель образования стандартная для восточнославянских фамилий: прозвище на -ек + патронимический суффикс -ов. Мозжеков — буквально «сын Мозжека». Фамилия эта довольно редкая. По данным переписей, основные гнёзда Мозжековых находятся в Поволжье (особенно в Самарской и Ульяновской областях) и на Урале. Это указывает на возможную связь с вольными переселенцами или казачеством, где прозвища часто были яркими и неблагозвучными по меркам высшего сословия.

Интересно, что фамилия могла возникнуть и в среде старообрядцев, которые нередко сохраняли архаичные словоформы. В говорах встречается слово «мозжек» — затвердение, шишка на кости (от «мозг» в значении «костный мозг»). Тогда прозвище могло относиться к человеку с заметной шишкой или наростом на голове. Эта версия менее популярна, но лингвистически безупречна: суффикс -ек в диалектах часто обозначал предмет, похожий на то, что названо корнем.

Сословной принадлежности у Мозжековых, скорее всего, не было: в документах XIX века носители фамилии встречаются среди крестьян и мещан, реже — среди купцов. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.