Фамилия Мсягин — редкая, и её разбор требует внимания к нестандартной основе. В отличие от распространённых фамилий на -ов/-ев, -ин, в которых корень обычно прозрачен, Мсягин ставит перед исследователем загадку: что такое «Мсяг-»?

Самый прямой путь — через суффикс -ин. Он указывает на принадлежность к отцу или к прозвищу, оканчивающемуся на -а/-я. То есть Мсягин — это «сын Мсяги» или «человек из рода Мсяги». В основе лежит имя или прозвище Мсяга. Но откуда оно взялось?

Вероятнее всего, это диалектное или искажённое слово. В русских говорах встречается глагол «мсякать» или «мсягнуть» — стучать, греметь, издавать глухой звук. Прозвище Мсяга могли дать человеку с громким голосом, неуклюжему, или, наоборот, тому, кто работал с металлом — кузнецу или жестянщику, чья работа сопровождалась шумом. Другая гипотеза связывает основу с «мсяг» — так в некоторых областях называли болотистое место, мочажину. Тогда прозвище могло относиться к жителю сырой низины.

С фамилией на -ин обычно связывают северные и центральные регионы России, где патронимическая модель на -ин была особенно сильна. Однако Мсягин явно не принадлежит к массовым фамилиям, и его география, скорее всего, локальна. В переписях и архивных записях она почти не встречается, что говорит о её происхождении в небольшой крестьянской среде, возможно, в одной из деревень Ярославской, Костромской или Вологодской губерний, где диалектные формы слов сохранялись дольше.

Не стоит искать в фамилии Мсягин древний дворянский корень. Это типичная «деревенская» фамилия, образованная от бытового прозвища, которое со временем потеряло свой первоначальный смысл. Носитель такой фамилии мог быть потомком кузнеца, плотника или просто человека с характерным голосом, чьё прозвище закрепилось за родом.