Фамилия Муфтяхитдинов — редкий случай, когда основа имени говорит о человеке больше, чем его суффикс. Вопреки привычной модели русских фамилий на -ов, здесь главное — не «чей сын», а «какой человек». Имя Муфтяхитдин — сложное, арабско-персидское по происхождению, и его разбор даёт ключ к пониманию фамилии.

Первая часть, «муфти», восходит к арабскому «муфтий» — исламский богослов, знаток шариата, имеющий право выносить правовые заключения (фетвы). Вторая часть, «яхитдин», — это искажённое «ахи ад-Дин» или «ах ад-Дин»: «брат веры» или «брат религии». Полное имя Муфтяхитдин, таким образом, можно перевести как «муфтий, брат веры» или «богослов, брат религии». Это не просто имя, а титулованное прозвище-пожелание, которое давали человеку, чтобы подчеркнуть его благочестие и учёность.

Фамилия образована по русской модели: к основе имени добавили суффикс -ов, что означает «сын Муфтяхитдина» или «принадлежащий роду Муфтяхитдина». Такая гибридная форма — тюркское или татарское имя плюс русский суффикс — характерна для татарских и башкирских фамилий, которые складывались в XIX–XX веках при взаимодействии с русской административной системой. В среде казанских татар, мишарей или сибирских татар подобные фамилии встречаются чаще всего.

Географически фамилия тяготеет к регионам с компактным проживанием татарского и башкирского населения: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская, Челябинская, Ульяновская области. Встречаются варианты написания: Муфтяхитдинов, реже — Муфтяхитдинов (с одним «ф»). Вариант с «х» вместо «к» (Муфтякитдинов) — скорее всего, результат диалектного произношения или описки в документах.

Родственные фамилии по той же модели — Муфтахов, Муфтиев, Ахтямов, Ахиддинов — показывают, что корень «муфти» и элемент «дин» (вера) в татарской ономастике не редкость, но именно сращение двух смыслов в одной основе делает Муфтяхитдинова уникальным. Предок носителя фамилии, вероятно, был уважаемым человеком в общине — не обязательно сам муфтием, но, возможно, муллой, учителем медресе или просто набожным старцем, которого в шутку или всерьёз прозвали «муфтием веры».