Фамилия Мугатабаров — редкий случай, когда основа ясна почти сразу, а вот путь, которым она вошла в русский обиход, заставляет задуматься. Корень здесь — арабское имя или прозвище Мугатабар (варианты: Мугаттабар, Мукаттабар). В арабском языке это слово связано с глаголом, означающим «быть отрезанным, отделённым», а в переносном смысле — «избранный, выделенный из среды». В мусульманской ономастике так могли назвать ребёнка, желая подчеркнуть его исключительность, или же это было прозвище человека, который чем-то резко отличался от окружающих — положением, внешностью или характером.

Фамилию образовали по стандартной русской модели: к основе Мугатабар прибавили суффикс принадлежности -ов. Формально это отчество: «сын Мугатабара». Суффикс указывает на то, что фамилия складывалась в среде, где уже действовали великорусские патронимические нормы, — скорее всего, в среде служилых татар, башкир или представителей других тюрко-мусульманских народов, которые переходили на русскую фамильную систему в XVI–XIX веках.

Интересная деталь: написание с буквой «г» в корне (Мугатабар, а не Мукаттабар) выдаёт не арабское, а тюркское посредничество. В тюркских языках глухой «к» на стыке с гласными часто озвончается, поэтому арабское «каф» превратилось в «г». Это верный признак того, что фамилия пришла не напрямую из арабского мира, а через татарскую или башкирскую среду, где имя уже обкаталось в местном произношении. Носители фамилии — потомки людей, носивших это имя; никаких сведений о сословной принадлежности (дворяне, купцы, крестьяне) в открытых источниках нет, но сам факт бытования такой сложной арабской основы в русском окончании говорит о том, что предок был человеком грамотным или заметным в своей общине.