Фамилия Мугатин — редкий случай, когда основа вызывает больше вопросов, чем суффикс. А суффикс здесь самый ходовой в русской антропонимии: -ин. Он указывает на принадлежность: Мугатин — это «чей?» — сын или потомок человека по имени или прозвищу Мугата.

Слово «мугата» в литературном русском языке не зафиксировано. Но в южных и юго-западных говорах (рязанских, тамбовских, воронежских) «мугатый» значило «грязный, неопрятный, чумазый». Человека, который ходил немытым или работал в грязи, могли прозвать Мугатой. В старину прозвища по внешнему виду или опрятности давали легко и без злого умысла — как бытовую примету. Именно эта версия выглядит самой правдоподобной: от диалектного прилагательного «мугатый» через прозвище Мугата.

Есть и другая, менее вероятная, но любопытная гипотеза. В тюркских языках (например, в татарском) встречается слово «мөгәт» — «срок, время». Гипотетически прозвище Мугата могло означать «своевременный» или «терпеливый». Однако для фамилий с русским суффиксом -ин тюркская основа обычно более очевидна (типа Батыршин, Асанов), а здесь она не подкреплена ни географией, ни документами. Поэтому диалектное русское происхождение предпочтительнее.

С точки зрения социальной истории, фамилия Мугатин могла возникнуть в крестьянской среде Черноземья. В документах XVII–XVIII веков фамилии на -ин у крестьян и однодворцев южных губерний — обычное дело. Носители фамилии, скорее всего, были землепашцами или ремесленниками, а прозвище закрепилось за родоначальником из-за его неопрятного вида или, наоборот, в насмешку над чистюлей.

Фамилия редкая. В современных справочниках она не значится среди массовых, а встречается точечно — в основном в Центральной России и в регионах, куда переселялись крестьяне из южных губерний в XIX–XX веках. Поиск по открытым данным показывает её носителей в Тамбовской, Липецкой и Воронежской областях, что косвенно подтверждает диалектную версию.

Итог простой: Мугатин — русская фамилия от прозвища Мугата, которое, скорее всего, дали человеку, не следившему за чистотой. Никакой аристократии, зато живая связь с народной речью, которую сегодня почти не услышишь.