Фамилия Мугатаров — редкая и неоднозначная по происхождению. Её основа, скорее всего, не русская, а тюркская или арабо-персидская, что указывает на восточные корни носителей. Разберёмся по порядку.

Первое, что бросается в глаза — суффикс -ов. Он типичен для русских фамилий, образованных от имён или прозвищ, и показывает, что фамилия русифицировалась: к тюркской основе добавили стандартный русский патронимический суффикс. В тюркских языках аналогов такого суффикса нет, там фамилии часто оканчиваются на -ов/-ев лишь после вхождения народов в состав Российской империи.

Корень «Мугатар» или «Мугаттар» скорее всего восходит к арабскому слову «мугаттар» (معطر) — «надушенный», «благоухающий», «ароматный». В персидском и тюркских языках это слово могло стать личным именем или прозвищем, которое давали человеку с приятным запахом, торговцу благовониями или просто как пожелательное имя. В исламской традиции имена, связанные с приятными запахами, не редкость.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная: основа от тюркского «мугат» — «священный», «почитаемый» (от арабского «мукаддас»). Однако фонетически «Мугатаров» ближе к первому варианту, так как в тюркских языках «мугаттар» встречается в именах и фамилиях (например, Мугаттаров). Удвоение «т» в корне могло упроститься в русской записи до одного.

Географически фамилия Мугатаров встречается в основном среди татар, башкир и народов Кавказа. По данным открытых источников, наибольшая концентрация — в Татарстане и Башкортостане, что подтверждает тюркское происхождение. Встречается она и у азербайджанцев, где «Мугаттар» — вариант имени.

Социальный контекст: предки носителей фамилии могли быть либо торговцами благовониями (парфюмерами, аптекарями), либо людьми, получившими прозвище за внешнюю опрятность или духовную чистоту. В любом случае, фамилия не крестьянская и не дворянская — скорее, городская или ремесленная, что типично для татарских и башкирских фамилий, появившихся в XVIII–XIX веках.

Сравните с однокоренными: Мугаттаров (с двойной «т») — более точная арабская транскрипция, Мугатаров — обрусевшая форма. Фамилия редкая, и её носители, вероятно, происходят из одного небольшого рода, так как массового распространения она не получила.