Фамилия Мукадесов — редкий случай в русском ономастиконе. Её основа не славянская, а тюркская или арабо-персидская, что сразу указывает на путь, по которому стоит двигаться в поисках корней.

В основе фамилии лежит личное имя Мукадес. Это имя восходит к арабскому «мукаддас» — «святой», «священный». В мусульманской традиции так могли назвать ребёнка в знак благочестия или в честь святых мест (например, Иерусалим по-арабски — Аль-Кудс, то есть Святыня). Таким образом, Мукадес — это имя-пожелание, аналог христианского имени Святой или Благословенный.

Русский суффикс -ов превратил имя в фамилию по стандартной модели: «чей?» — «Мукадесов», то есть сын, потомок Мукадеса. Такое оформление типично для фамилий, возникших в среде крещёных татар, башкир, казахов или других народов Поволжья и Урала, которые входили в состав Российской империи и принимали православие. Фамилия закрепилась за одним родом, когда предок, носивший имя Мукадес, переходил в христианство или просто получал документы на русском языке.

Встречается фамилия крайне редко. По открытым данным, основные носители живут в Татарстане, Башкортостане и в Оренбургской области — регионах, где веками шёл процесс культурного и языкового смешения. Не исключено, что первоначальное имя звучало как Мукаддас, а в бытовой речи редуцировалось до Мукадес — это обычное дело при адаптации арабизмов в тюркских языках.

Если сравнивать с однокоренными, то фамилия Мукадесов стоит особняком. В русском языке есть фамилии Кадиров (от «кади» — судья) или Хазов (от «хаз» — уважаемый), но прямых аналогов с корнем «святой» почти нет. Это делает фамилию не только редкой, но и семантически яркой: она буквально несёт значение «святой» в своей основе.