Фамилия Мукагов — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Если посмотреть на её окончание, то бросается в глаза суффикс -ов, который в русских фамилиях обычно указывает на принадлежность: «чей?» — Мукагов, то есть сын или потомок Мукага. Но вот что скрывается за основой «Мукаг» — вопрос, на который нет одного ответа.

Самый вероятный путь — тюркское происхождение. В тюркских языках (татарском, башкирском, кумыкском, ногайском) корень «мука» может быть связан с арабским словом «мука́» (مُقَاء) — «рвота, тошнота», но в бытовых прозвищах это значение маловероятно. Гораздо чаще встречается основа от имени Мухаммад (Магомед), которая в диалектах могла сокращаться до Мука. В таком случае Мукаг — это вариант имени Мухаммад с тюркским аффиксом -аг/-ак, который в некоторых говорах даёт уменьшительно-ласкательную или просторечную форму (ср. Ахмад → Ахмакай, Мухаммад → Мукакай). Фамилия Мукагов тогда означает «потомок того, кого звали Мукаг» — то есть человека по имени Мухаммад в местном произношении.

Вторая версия, менее распространённая, но имеющая право на существование, — связь с кавказскими языками. В чеченском и ингушском есть слово «мука» — «мука́» (продукт), а суффикс -г может быть частью старого патронимического форманта. Однако для фамилии, оканчивающейся на -ов, это скорее исключение, так как подобные модели характерны для русской среды, а не для горских народов, где фамилии обычно не имеют такого окончания.

Географически фамилия Мукагов встречается в основном в регионах, где исторически смешивались тюркские и славянские традиции: в Астраханской области, в Ставрополье, среди ногайцев и кумыков, а также в среде кавказских народов, принявших русскую модель фамилий. Встречается она и в Дагестане, где её носителями могут быть кумыки или аварцы.

Интересная деталь: если бы фамилия образовывалась по правилам русского языка от слова «мука́» (продукт), она звучала бы как Мучников или Мука́ев (от «мука» + «-ев»). Форма Мукагов с твёрдым -г выдаёт иноязычный корень, который не склонялся по русским законам, а просто получил патронимический суффикс. Это типичный пример «обрусения» фамилии: тюркское или кавказское личное имя или прозвище обрастает русским окончанием.

Таким образом, носитель фамилии Мукагов, скорее всего, имеет предка по мужской линии, которого в быту звали Мукаг — сокращённая форма от имени Мухаммад или местное прозвище, закрепившееся в документах при переписях населения.