Фамилия Мухамадияров — одна из тех, что звучат как целая родословная в одном слове. Её основа — сложносоставное мусульманское имя, и у исследователей есть две основные версии того, как оно возникло.

Первая версия отталкивается от двух самостоятельных имён. Первая часть — Мухамад (арабское «прославляемый», один из эпитетов пророка). Вторая — Дияр, что в арабском означает «страна, земля», а в некоторых тюркских языках, например в курдском, — «дар, подарок». Сторонники этой гипотезы предлагают буквальный перевод: «прославляемая земля» или «прославляемый дар». Красиво, но лингвистически это скорее народная этимология: в реальной практике имяобразования редко склеивали два независимых имени без соединительной логики.

Правдоподобнее выглядит вторая версия, и именно её придерживаются ономасты. Фамилия восходит к арабо-персидскому имени Мухаммадьяр. На персидском языке «яр» — это «друг, товарищ, помощник». Отсюда значение — «друг пророка Мухаммада», то есть человек, близкий к пророку по духу или верности. Это типичная модель для мусульманских имён, где к имени пророка добавляли определение, подчёркивающее преданность вере. Именно такое имя носил, например, известный средневековый поэт Мухаммадьяр, писавший на старотатарском языке.

Сам же суффикс -ов в конце фамилии — чисто русский, патронимический. Он указывает на принадлежность: Мухамадияров буквально означает «сын Мухамадияра». Такую форму фамилия приобрела уже после XVI века, когда татары, башкиры и другие народы Поволжья и Урала вошли в состав Русского государства и начали адаптировать свои имена к русской модели словообразования. Фамилия закрепилась в среде татарского и башкирского дворянства и духовенства, а позже распространилась шире — её носителей можно встретить по всему Волго-Уральскому региону и в Средней Азии.

Разница между написаниями «Мухамадияров» и «Мухаммадьяров» объясняется просто: в арабском оригинале удвоенная «м», но в русской передаче через тюркское посредничество она часто упрощалась. Так что обе формы — родные, и обе указывают на одно и то же имя-основу.