Фамилия Мухорин образована от прозвища Мухора. По одной из версий, оно ведет свое начало от диалектного глагола «мухориться», который в архангельских говорах имел значение «хмуриться, становиться пасмурным», «печалиться». Вероятно, прозвище Мухора содержало указание на особенности характера и поведения основателя фамилии (суровость, угрюмость). Возможно также, что прозвище Мухора имеет схожую этимологию с прилагательным «мухорный», которое в пермских говорах означало «хилый, тщедушный», а в свердловских – «малорослый». В таком случае Мухорой могли прозвать либо очень худого, щуплого, либо невысокого человека. Так и прозвище Мухора закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Мухорин. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Мухора, со временем получил фамилию Мухорин.