Фамилия Мукосеев образована от прозвища Мукосей. Оно восходит к существительному «мука», то есть «смолотое хлебное зерно» и глаголу «сеять» в значении «пропускать через сито». В старину Мукосеями было принято называть рабочих, занятых просеиванием муки. Таким образом, именование Мукосей относится к профессиональным и указывает на род деятельности его обладателя. Так и прозвище Мукосей закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Мукосеев. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Мукосей, со временем получил фамилию Мукосеев. Так, в Книге памяти Курской области упоминается Александр Михайлович Мукосеев, родившийся в 1901 году в селе Волоньица Брацлавского района Каменец-Подольской области. В Книге памяти Астраханской области содержится информация об Александре Федоровиче Мукосееве, родившемся в 1877 году и проживавшем в Астрахани. В документах Пензенской области можно найти сведения о Василии Ивановиче Мукосееве, родившемся в 1899 году в селе Репьевка Сердобского района Пензенской области.