Фамилия Мукосей образована от аналогичного прозвища, которое восходит к нарицательному «мукосей». Мукосей — это рабочий, занятый просеиванием муки. Таким образом, эта фамилия относится к так называемым «профессиональным» именованиям, указывающим на род деятельности человека.