Фамилия Макосеев — одна из тех, где на первый взгляд всё ясно, а при ближайшем рассмотрении начинаются споры. В ней отчётливо читается суффикс -ев, который в русской фамильной модели указывает на отчество: «чей?» — Макосеев, то есть сын Макосея. Вопрос упирается в имя или прозвище Макосей.

Самая прямая версия ведёт к имени Макарий (от греческого «макариос» — блаженный, счастливый). В народном произношении это имя давало множество форм: Макар, Макарий, Макарей, а в некоторых говорах — Макасей. Ударение в фамилии на третий слог (Макосе́ев) как раз поддерживает эту версию: полногласная форма Макасей через аканье (произношение «о» вместо «а» в безударном положении) дала Макосей. То есть Макосеев — то же самое, что и более привычные Макаров или Макарьев, но через редкую диалектную ветвь.

Вторая версия, более редкая, связывает основу с карельским или финским именем Мокко (уменьшительное от Мокей), которое в русской среде могло обрасти суффиксом -осей. Но здесь сложнее: фамилия Макосеев почти не встречается на Северо-Западе, где такое влияние было бы вероятно. Основной ареал фамилии — центральные и южные области России (Тульская, Рязанская, Воронежская), что говорит в пользу первого, славянского пути через имя Макарий.

Интересная деталь: в старых переписных книгах XVII века встречаются отдельные записи «Макосейка», «Макосей» как самостоятельные имена, а не прозвища. Это подтверждает, что форма была живой и употребительной, а не случайным искажением. Таким образом, предок носителя фамилии, скорее всего, звался Макосеем — и был либо крестьянином, либо посадским человеком, никак не связанным с духовенством, поскольку церковная форма имени (Макарий) осталась бы в фамилии как Макарьев.