Фамилия Мунжуков образована от тюркского имени Мунжук, которое в переводе на русский язык означает «жемчуг». Согласно Корану, жемчуг рос на деревьях райского сада. Согласно другой версии, фамилия восходит к прозвищу Мунжук, образованному от монгольского слова «мунж», что переводится как «новичок, ученик». Можно предположить, что прозвище Мунжук подчеркивало социальный статус человека. Возможно также, что прозвище связано с киргизским словом «манжын» — «седло со всеми принадлежностями». Соответственно, Мунжуком могли называть либо лихого наездника, либо того, кто занимался изготовлением седел, конской упряжи.