Фамилия Муратхузин — наглядный пример того, как в русской ономастике приживаются имена восточного происхождения. Её основа — составное арабское имя Муратхуза (вариант написания — Муратходжа), где первая часть «Мурат» означает «желанный», «цель», а вторая «хузя» (от «ходжа») — «господин», «хозяин», «наставник». В сумме имя можно перевести как «желанный господин» или «почтенный, кого ждали».

Фамилия образована по русской патронимической модели с суффиксом -ин, который в данном случае присоединяется к основе на гласную: Муратхуз(а) + ин. Суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?») — буквально «сын Муратхузы». Такая модель характерна для фамилий, возникших в среде татарского и башкирского дворянства и духовенства, где арабские и персидские имена с компонентом «ходжа» были особенно распространены.

Изначально имя Муратхуза носил, скорее всего, человек с религиозным или торговым статусом. «Ходжа» — это не просто имя, а титул, который давали купцам, ведущим дальнюю торговлю, или потомкам пророка. Поэтому предок носителя фамилии мог быть либо уважаемым муллой, либо зажиточным купцом из казанских или оренбургских татар.

Фамилия редкая и имеет чёткую географическую привязку. Подавляющее большинство Муратхузиных живёт в Татарстане, Башкортостане и прилегающих областях. Встречается она и в Казахстане, что объясняется общностью тюркского культурного слоя. Вариант написания через «з» (Муратхузин) — результат адаптации звука «з» в русской передаче; в оригинале имя звучало бы ближе к «Муратходжа», но в русских документах закрепилась форма с «узин» по аналогии с другими фамилиями на -узин.

Интересно, что фамилия не претерпела типичного для русских фамилий сокращения: например, от имени Муратходжа могли бы образовать Муратов или Ходжин, но здесь сохранилась полная двухкомпонентная основа. Это говорит о том, что имя было осознано как цельное и не дробилось на части при записи в метрических книгах.