Фамилия Мусаатаева — редкая и составная, что сразу привлекает внимание. Её основа — двусоставное арабское или тюркско-мусульманское имя Мусаата, которое само по себе требует разбора. Первая часть, «Муса», — это арабская форма библейского имени Моисей, широко распространённая у народов, исповедующих ислам. Вторая часть, «ата», имеет тюркское происхождение и означает «отец», «предок» или почтительное обращение к старшему. Таким образом, имя Мусаата можно перевести как «Муса-отец» или «Муса-предок». Скорее всего, так называли человека в знак уважения или для отличия от других носителей имени Муса.

Фамилия образована по типичной для русского языка модели с суффиксом -ев, который присоединяется к основам, оканчивающимся на согласный или гласный. В данном случае к полной форме имени Мусаата прибавили фамильный суффикс -ев и окончание -а, указывающее на женский род. Поэтому фамилия Мусаатаева — это «женский» вариант, а мужской звучал бы как Мусаатаев. Такая форма говорит о том, что фамилия закрепилась в русской или русифицированной среде, где отчества и фамилии женщин оформлялись окончанием -а.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где смешались тюркские и арабские традиции имянаречения: это Северный Кавказ (особенно Чечня и Ингушетия), а также народы Поволжья (татары, башкиры). Встречается она и у казахов, где имя Мусаата (или Муса-ата) могло быть прозвищем уважаемого старейшины. В отличие от фамилий, образованных от ремёсел или профессий, эта — чисто патронимическая, то есть указывает на имя отца или родоначальника.

С точки зрения ономастики, фамилия Мусаатаева интересна тем, что демонстрирует двойную культурную адаптацию: сначала арабское имя получило тюркский компонент («ата»), а затем вся конструкция прошла через русскую фамильную модель. Это не редкость для окраин Российской империи, где в XIX–XX веках шёл активный процесс фиксации фамилий. Носители этой фамилии, вероятно, происходят из семьи, где предок носил имя Мусаата, что могло быть связано с его религиозным авторитетом или почтенным возрастом. Других, более экзотических версий — например, происхождения от географического названия — для этой фамилии не существует.