Фамилия Мусаелов звучит на русский лад, но корни ее уходят в армянскую ономастику. В армянской традиции фамилии часто происходят от «азгануна» — имени клана, и Мусаелов не исключение. Сама фамилия образована от личного имени Мусаел с помощью славянского суффикса -ов, что указывает на позднейший этап русификации. Тесные контакты Армении с Российской империей, особенно после вхождения ее части в состав последней в 1878 году, привели к тому, что многие армянские родовые имена получили привычные для русского уха окончания.

Имя Мусаел имеет как минимум две версии происхождения. По одной из них, это армянский вариант библейского имени Мафусаил (ивритское Метушелах). В Библии Мафусаил — один из праотцов человечества, сын Еноха и отец Ламеха, которого он родил в 187 лет. Его имя стало нарицательным для долгожителя, отсюда выражение «мафусаилов век». Само древнееврейское имя предположительно складывается из слов «мавет» («смерть») и «шелах» («меч») либо «шалах» («отсылать»). Согласно другой гипотезе, фамилия восходит к мусульманскому мужскому имени Мусал, которое переводят как «соглашающийся» или «простодушный». Вторая версия выглядит менее убедительной, поскольку армянская ономастика, хотя и унаследовала еврейские, арабские, персидские и особенно турецкие элементы, в данном случае опирается на устойчивую библейскую традицию, хорошо знакомую армянской церкви.

Первоначально фамилия Мусаелов означала «из рода Мусаела», что типично для клановых имен. Суффикс -ов, добавленный при русификации, закрепил эту форму в русском языке, превратив родовое прозвище в фамилию, которую мы знаем сегодня.